Отделение протеомики

Отделение протеомики оснащено современным оборудованием для изучения межмолекулярных взаимодействий и препаративного разделения биологических молекул.

Оборудование

Оптический биосенсор Proteon XPR36 (Bio Rad Laboratories) с полным комплектом программного обеспечения для анализа межмолекулярных взаимодействий

Автоматизированная система для изучения взаимодействия белков с белками, пептидами, нуклеиновыми кислотами и низкомолекулярными веществами методом поверхностного плазмонного резонанса (ППР). Данная система позволяет проводить одновременно анализ взаимодействия максимум шести лигандов с шестью аналитами и получить кинетические профили взаимодействия в одном эксперименте. Система ProteOn XPR36 включает все компоненты, необходимые для анализа взаимодействия: контрольно-измерительные приборы, программное обеспечение ProteOn Manager, сенсорные чипы ProteOn, растворы буферов и реагентов, комплект для создания протоколов. Удобное программное обеспечение ProteOn Manager отличается гибким, контролируемым подходом к согласованному управлению прибором, постановке эксперимента и анализу данных. Использование данной системы повышает производительность, гибкость и универсальность эксперимента, обеспечивая проведение большего количества экспериментов за меньшее время.

Хроматографическая система BioLogic DuoFlow Pathfinder (Bio Rad Laboratories) с коллектором фракций и программным обеспечением

Хроматографическая система BioLogic DuoFlow применяется для разделения и очистки биомолекул c высокой степенью разрешения, с возможностью динамического смешивания растворов. BioLogic DuoFlow позволяет работать со скоростями потока до 80 мл/мин и осуществлять высокоточный контроль за протеканием процесса с использованием кондуктивных, рН мониторов, а также 4-х волнового сканирующего детектора QuadTec UV/Vis. Множество различных подставок для пробирок обеспечивают большие возможности по сбору образцов от одной капли до литров.

Система анализа хемилюминисцентных и флюоресцентных изображений G:BOX Chemi XX9 (Syngene)

Новое поколение систем G:BOX Chemi позволяет решать большое количество задач, включая получение флуоресцентных и хеми-люминисцентных изображений. Данные системы в настоящее время работают под управлением новаторского программного обеспечения GeneSys, ответственного за автоматический контроль аппаратуры. В то же время, несмотря на сотни стандартизованных протоколов захвата изображений, имеющихся в базе денных, в любой момент систему можно переключить на ручное управление и получить необходимый результат. Системы G:BOX Chemi имеют фотокамеры с разрешением от 1.4 до 8.3 мегапикселей. Наличествует также система охлаждения, эффективно минимизирующая шум электронного происхождения, с тем, чтобы конечные изображения имели минимальные искажения. Новый стильный дизайн систем модульного типа включает моторизованный объектив и колесо выбора фильтров с возможностью выбора нескольких типов освещения вне зависимости от использования Epi подсветки и трансиллюминации.

Спектрофотометр планшетный XMark

Спектральные характеристики веществ в заданном диапазоне или при определенной длине волны. Фотометрические измерения в 6-, 12-, 24- и 96-луночных микропланшетах в конечной точке или в режиме реального времени.

Услуги, оказываемые отделением

1. Изучение межмолекулярных взаимодействий методом поверхностного плазмонного резонанса.

Использование оптического биосенсора Proteon XPR36 с полным комплектом програмного обеспечения для анализа межмолекулярных взаимодействий, основанного на использовании метода поверхностного плазмонного резонанса. Биосенсор Proteon XPR36 позволяет изучать до 36 различных связываний одновременно.
Анализ проводится на чипах, которые подходят для изучения широкого спектра взаимодействий – белок - белковых, белков с пептидами, белков с нуклеиновыми кислотами и низкомолекулярными веществами. При проведении анализа можно определить концентрацию, кинетические и равновесную константы взаимодействия.
Предлагается 5 видов чипов для иммобилизации: 3 для пришивки аминогрупп лиганда к карбоксильным группам подложки (низкой, средней, высокой емкостей), 1 чип с нейтравидиновым покрытием для пришивки биотинилированных молекул и 1 чип для иммобилизации молекул с His-группами.

2. Разделение белков и пептидов методом двумерного электрофореза.

Использование прибора Protean IEF Cell для фокусирования белков по изоэлектрическим точкам с последующим разделением методом гель-электрофореза в камере Protean II xiCell или Dodeca Cell (система для использования готовых гелей с красителем).
Для идентификации белков после проведения двумерного электрофореза используется система анализа хемилюминисцентных и флюоресцентных изображений G:BOX Chemi XX9.
Пробоподготовка для последующего проведения масс-спектрометрии.

3. Хроматографическое аналитическое и препаративное разделение биологических молекул.

Использование хроматографической системы низкого давления BioLogic DuoFlow позволяет проводить высокоэффективное аналитическое и препаративное разделение биологических молекул. BioLogic DuoFlow позволяет работать со скоростями потока до 40 мл/мин и осуществлять высокоточный контроль за протеканием процесса с использованием кондуктивных и pH мониторов, а также 4 волнового сканирующего детектора QuadTec UV/ Vis.